株式会社国際バイオインフォマティクス研究所［BiGG］

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講座番号	BT001	レベル	初級コース
講座名	分子生物学
講座概要	分子生物学の基礎となる細胞ならびに細胞内での生体分子（DNA、タンパク質）に関する基本的な知識を学習します。
講座詳細	１.　　細胞とは２.　　原核生物と真核生物３.　　細胞内小器官　４.　　遺伝子とＤＮＡの２重らせん　５.　　染色体とゲノム６.　　ＤＮＡの化学構造７.　　ＤＮＡの連結８.　　塩基（ＡＣＧＴ）９.　　ＲＮＡとＤＮＡ１０.　タンパク質の設計図としてのＤＮＡ１１.　セントラルドグマ１２.　転写１３.　スプライシング１４.　翻訳１５.　遺伝暗号表（コドンテーブル）１６.　アミノ酸１７.　アミノ酸の種類１８.　タンパク質１９.　細胞分裂２０.　複製

講座番号	BT002	レベル	初級コース
講座名	分子生物実験技術
講座概要	分子生物学の研究において利用されている基本的な実験技術とバイオテクノロジー（遺伝子工学）技術について解説します。
講座詳細	１．ＤＮＡを対象とした実験　１．１　アガロース電気泳動　１．２　制限酵素　１．３　リガーゼ　１．４　PCR 　１．５　サンガー法（ジデオキシ法）によるＤＮＡ配列決定　１．６　ｃＤＮＡライブラリー２．遺伝子発現を解析する実験　２．１　遺伝子発現とは　２．２　ノーザンハイブリダイゼーション　２．３　マイクロアレイ３．タンパク質を対象とした実験　３．１　タンパク質とアミノ酸　３．２　エドマン分解　３．３　クロマトグラフィー　３．４　質量分析（マススペクトロメトリ）４．タンパク質発現を解析する実験　４．１　抗原抗体反応　　４．２　ウェスタンハイブリダイゼーション５．ゲノムDNAを対象とした実験　５．１　ショットガン法　５．２　サザンハイブリダイゼーション　５．３　フィンガープリント　５．４　RFLP

講座番号	BI002	レベル	初級コース
講座名	バイオインフォマティクス「公共データベース」
講座概要	公共の研究機関が提供しているデータベースサイトの中で、基本的かつ利用頻度の高いサイトについて、サイトの利用法と搭載データについて概説します。
講座詳細	１．データベースとは２．塩基配列（DNA）データベース　２．１　国際塩基配列データベース　　　　　（NCBI、DDBJ、EBI）　２．２　RefSeq ３．タンパク質構造、モチーフデータベース　３．１　PDB 　３．２　モチーフとは　３．３　InterPro ４．タンパク質機能データベース　４．１　GO（GeneOntology）５．分子間相互作用データベース　５．１　BIND 　５．２　KEGG 　５．３　DIP ６．統合データベース　６．１　H-invitational 　６．２　Ensembl 　６．３　UnoProt 　６．４　Entrez ７．文献検索　７．１　PubMed 　７．２　OMIM

※BI101講座の受講には、ノートPCの利用が必須となります。ノートPCをお持ちの方はご持参ください。お持ちでない方には、弊社でご用意できますので（レンタル料金、5,250円/日）、お申し込みの際お伝えください。

講座番号	BI101	レベル	中級コース
講座名	バイオインフォマティクス　「遺伝子の機能推定＜遺伝子機能に関する情報の付与および抽出＞」
講座概要	研究対象となるDNA断片が含んでいる遺伝子の機能を推定することはウェット実験における計画に必要な作業です。本講座では、ウェブで公開されているツールを用いて遺伝子の機能推定を行う手法を実習を交えて学習します。
講座詳細	（１日目）１．生物の成り立ちと構成　１．１細胞の種類　１．２細胞の構成２．生物における情報の流れ　２．１生体内で行われる情報のやり取り　２．２バイオインフォマティクスの関わり３．遺伝子とゲノム　３．１ゲノム・核酸・遺伝子　３．２遺伝子の構造４．primary（一次）データベース　４．１核酸データベース　　　　・ＤＤＢＪ／ＥＭＢＬ／ＧｅｎＢａｎｋ　　　　・その他のデータベース　４．２タンパク質関連データベース　　　　・UniProt KnoledgeBase 　　　　・Protein Data Bank ５．遺伝子の機能推定の実際　５．１これまでの成果　５．２ヒト　５．３マウス６．（実習）ウェブツールを用いた塩基（アミノ酸）配列の機能推定　６．１　タンパク質コード領域解析（ORF Finder）　６．２　配列相同性解析（BLAST）　６．３　タンパク質モチーフ解析（InterPro）　６．４　タンパク質の膜貫通領域推定（SOSUI）（２日目）７．生命科学データベースの種類　７．１　統合型データベース　７．２　生物特異的データベース　７．３　機能特異的データベース　７．４　文献データベース　７．５　疾患関連データベース８．公開データフォーマット　８．１塩基配列データベースの公開フォーマット　８．２タンパク質データベースの公開フォーマット９．データベースからのデータ取得　９．１塩基配列データベース　９．２タンパク質データベース１０．（実習）データベースを利用したキーワード検索による遺伝子の機能および関連情報の抽出　１０．１統合データベース　Ｅｎｔｒｅｚ　１０．２ヒト遺伝子データベース　H-Invitational Database 　１０．３タンパク質解析と機能データベース　Expasy Proteomics Server

※BI102講座の受講には、ノートPCの利用が必須となります。ノートPCをお持ちの方はご持参ください。お持ちでない方には、弊社でご用意できますので（レンタル料金、5,250円/日）、お申し込みの際お伝えください。

講座番号	BI102	レベル	中級コース
講座名	バイオインフォマティクス「遺伝子発見テクニック」
講座概要	ＤＮＡ配列データに対する機知情報を付加して行く作業は、アノテーション（注釈）と呼ばれます。近年の配列データの増加により連続的にアノテーションを行う必要が出てきています。本講座では、アノテーションストラテジーの構築から結果の解釈までに必要な知識の学習を行います。
講座詳細	（１日目）１．アノテーションとは何か　１．１対象生物による遺伝子構造の違い　１．２ゲノムから何が読み取れるか　　１．３国債塩基配列データベースに登録してあるデータの見方　　　　フラットファイルの説明　　１．４既存アノテーションデータの問題点　　　　どのようなアノテーションが好ましいか２．アノテーションストラテジーの立て方　２．１対象生物とその研究背景によるストラテジーの違い　２．２解析手法に　　・相同性検索プログラム　　・遺伝子予測プログラムの利用　　・モチーフ検索プログラム　　・その他（疎水性、局在化予測プログラム）　２．３アノテーションに必要なリソースとツールの紹介　２．４アノテーションパイプラインとは　２．５解析結果をどのように組み合わせたらよいか　　　ストラテジーを立ててみる３．（実習）アノテーション実践　３．１遺伝子の境界予測と機能予測　３．２相同性検索による遺伝子予測　３．３種々の相同性検索検索ツールの特徴　　　 blast、fasta、Smith-Waterman 　３．４blastの使い方、blast familyの使い分けとオプション　３．５ blastをローカルで動かす　３．６blastに必要なデータの取得方法　３．７blast結果の解釈　３．８ゲノムに対して相同性検索を行う（２日目）３．（実習）アノテーション実践（続き）　３．９　比較ゲノム　　近縁種ゲノムとの比較　　各遺伝子の周辺領域を他の生物と比較する　　代謝系の比較　３．１０モチーフ検索　　モチーフとは何か　　　ＩｎｔｅｒPro等による検索　３．１１遺伝子予測プログラムの利用　　　予測プログラムの利用　　　リピート領域とは　　　リピート領域のマスキング　　　プログラムの利用方法 Glimmer GeneScan 　　　５'末端の決定方法　　　予測感度について　３．１２tRNA、rRNA non-coding、RNA領域の予測　３．１３膜タンパク予測と局在化予測　３．１４相同性がない場合にどうするか　３．１５遺伝子の機能分類４．結果のまとめ方　４．１遺伝子Ｖｉｅｗｅｒの紹介　４．２データのＤＤＢＪへの登録　４．３アノテーションの更新

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